Final abierto

Honda Toru es una estudiante que después de la muerte de su madre decide vivir sola en una tienda de campaña en el bosque, propiedad de la familia Soma. Una noche es encontrada por Yuki Soma, el “príncipe” de su escuela, este y su primo Shigure le piden que viva con ellos. Dentro de la casa conoce a Kyo, otro integrante de la familia Soma y la terrible maldición que pesa sobre ellos que consiste que al ser abrazados por el sexo opuesto se transforman en animales del zodiaco chino (a excepción de Kyo que es el gato).

A la edad de 14 años Shinji Ikari is llamado por su padre a la ciudad de Neo Tokyo-3 después de varios años de separación. Allí acepta a regañadientes la tarea de convertirse en piloto un gigantesco robot llamado EVA01 y proteger el mundo de los enigmáticos invasores conocidos como “angeles”. A pesar de que repetidamente se pregunta por qué ha aceptado esta misión de su distante y frío padre, su hacerlo le ayuda a aceptarse gradualmente a sí mismo. Sin embargo, porque los ángeles están atacando la tierra y cual son las verdaderas intenciones de su padre sigue sin revelarse.

En la historia, Nanakorobi Nene, es una chica mejorada cibernéticamente, que se dirige a la isla metrópoli de Cenancle a vivir con su tía, pero ella no tiene forma de saber lo que hay en la tienda para ella. Un encuentro casual entrelaza su destino con el del super-rico inventor, Uzal Dalila, y su compañera adorable y gruñona, Clarion, que resulta ser también un cyborg como Nene. Nene está encantada de hacer un amigo, pero hay mas de Uzal y Clarion (y la isla de Cenancle en si misma) de lo que parece. Cuando un terrorista con superpoderes amenaza Cenancle, Uzal afirma que la única manera de evitar el desastre es que Nene haga equipo con Clarion y utilicen sus poderes combinados (¡Habilidades que Nene ni siquiera sabía que tenía!).